แม้ว่ากลไกการก่อโรคหลายอย่างจะนำไปสู่ปากมดลูกสั้น แต่ในผู้หญิงบางคน การสั้นลงของปากมดลูกเกิดจากการเปลี่ยนแปลงที่ไม่เป็นระเบียบของเมทริกซ์นอกเซลล์ที่อุดมด้วยคอลลาเจน แม่ตั้งครรภ์ (ECM) ของสโตรมาปากมดลูกลำดับชั่วคราวของการเปลี่ยนแปลงของปากมดลูกก่อนการคลอดแบ่งออกเป็นสองขั้นตอน