IgA nephropathy ส่งผลกระทบต่อไตโดยการโจมตี glomeruli glomeruli เป็นชุดของหลอดเลือดที่วนเป็นวงใน nephrons ซึ่งเป็นหน่วยทำงานเล็ก ๆ ของไตที่กรองของเสียและกำจัดของเหลวส่วนเกินออกจากเลือด การสะสมของ IgA ทำให้อักเสบและทำลาย glomeruli ทำให้ไตปล่อยเลือดและโปรตีนออกมาในปัสสาวะ ความเสียหายอาจนำไปสู่การเกิดแผลเป็นของ nephrons ซึ่งดำเนินไปอย่างช้าๆ เป็นเวลาหลายปี ในที่สุด โรคไตจาก IgA สามารถนำไปสู่โรคไตระยะสุดท้าย ซึ่งบางครั้งเรียกว่า ESRD ซึ่งหมายความว่า ท่อไต ทำงานได้ไม่ดีพอที่จะทำให้คนมีสุขภาพแข็งแรงได้อีกต่อไป เมื่อไตของบุคคลหนึ่งล้มเหลว เขาหรือเธอจำเป็นต้องได้รับการปลูกถ่ายหรือการกรองเลือดที่เรียกว่าการล้างไต