เพื่อให้ DNA สามารถทำซ้ำได้ ทั้งสองสายจะต้องคลายออกจากกัน เอ็นไซม์ที่เรียกว่า helicases คลายสายดีเอ็นเอทั้งสอง และโปรตีน เพิ่มเติม จะจับกับสายที่แยกจากกันเพื่อทำให้พวกมันเสถียรและป้องกันไม่ให้พวกมันจับคู่กันอีก นอกจากนี้ เอนไซม์ชั้นเยี่ยมที่เรียกว่า เซลล์ที่จะสืบพันธุ์ DNA โทโพไอโซเมอเรสจะกำจัดเกลียวที่บิดเป็นเกลียวโดยการตัดเส้นใดเส้นหนึ่งหรือทั้งสองเส้น แล้วปิดผนึกรอยตัดอีกครั้ง เอ็นไซม์เหล่านี้ยังสามารถแก้ให้ยุ่งเหยิงและไม่พันกันของ DNA เมื่อมันถูกขดเป็นเส้นใยโครมาตินอย่างแน่นหนา