การบริโภคอาหารเสริมแบคทีเรียสองชนิดที่มีแบคทีเรียสายพันธุ์เดียวกันต่างกันอาจส่งผลกระทบต่อจุลินทรีย์และโฮสต์อย่างมีนัยสำคัญ เนื่องจากความซับซ้อนของปฏิสัมพันธ์ จึงไม่แนะนำให้รับประทานผลิตภัณฑ์เสริมอาหารโปรไบโอติกที่มีคุณสมบัติที่อาจขัดแย้งกันในปริมาณที่มากเกินไป มีการทดลองแบบสุ่มที่มีกลุ่มควบคุม (RCTs) จำนวนมากขึ้นเรื่อย ๆ เพื่อประเมินประโยชน์ของโปรไบโอติกในการรักษาปัญหาสุขภาพช่องปาก เช่น โรคเหงือกอักเสบและโรคปริทันต์อักเสบ ในการทบทวนปัจจุบัน RCTs 36 เรื่อง (เผยแพร่ระหว่างปี 2009 ถึง 2021) ได้รับการตรวจสอบเพื่อทำความเข้าใจประโยชน์ของการบำบัดด้วยโปร ไบโอติกส์ สำหรับการจัดการปัญหาสุขภาพช่องปาก โปรไบโอติกที่มีการศึกษาบ่อยที่สุดคือการรวมกันของโปรไบโอติกสอง  สายพันธุ์ Lactobacillus reuteri  ซึ่งใช้ใน 17 RCTs ที่ประเมิน ตามด้วยโปรไบโอติกทั่วไปอื่นๆ